m6A研究又有新手段了？趕緊來(lái)了解一下吧！欄目：研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章，小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn)，ACA處被完全剪切，測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。原代心肌細(xì)胞培養(yǎng)傳代。廣西大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

3）基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測(cè)在進(jìn)行分子檢測(cè)的過(guò)程中，保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要，因此在取樣過(guò)程中，應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過(guò)程，將會(huì)導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無(wú)差別降解，嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測(cè)結(jié)果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi)，并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過(guò)程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對(duì)蛋白質(zhì)提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實(shí)驗(yàn)手段是分子學(xué)檢測(cè)中不可或缺的一部分，也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測(cè)數(shù)據(jù)。PCR主要用來(lái)對(duì)基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進(jìn)行定性或定量檢測(cè)，而WB則主要用來(lái)對(duì)某一蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)行定量檢測(cè)。（4）轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)檢測(cè)隨著檢測(cè)水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展，各類組學(xué)檢測(cè)的價(jià)格降低，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中也常常運(yùn)用組學(xué)檢測(cè)來(lái)提升實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的檔次。在我們進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測(cè)過(guò)程中，同樣是要首先確保目標(biāo)RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。廣西大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)總的來(lái)說(shuō)，動(dòng)物疾病模型是一種重要的研究工具，可以幫助科學(xué)家們更好地了解疾病的發(fā)生機(jī)制和開發(fā)新方法.

中華文化促進(jìn)會(huì)文化創(chuàng)新與傳播委員會(huì)會(huì)長(zhǎng)朱建聲、西安海棠學(xué)院院長(zhǎng)馮居秦、西安交通大學(xué)人文學(xué)院EDP中心主任、中華風(fēng)采人物媒體社長(zhǎng)王天保、西安市EMBA助企商會(huì)會(huì)長(zhǎng)張西安、陜西省糖尿病協(xié)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)張麗、陜西省養(yǎng)生協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)李靖、陜西省職業(yè)經(jīng)理人協(xié)會(huì)名譽(yù)會(huì)長(zhǎng)劉志超、西藏鷹山科技集團(tuán)董事長(zhǎng)張沛、西安天歌干細(xì)胞健康管理中心總經(jīng)理?xiàng)詈＼姾蛨F(tuán)隊(duì)及各行各業(yè)企業(yè)界朋友、受益者近200人參與了活動(dòng)。西安天歌干細(xì)胞健康管理有限公司總經(jīng)理?xiàng)詈＼娊榻B了成立一年來(lái)的工作情況和未來(lái)的發(fā)展布局。隨后，天歌干細(xì)胞健康管理中心負(fù)責(zé)人分別同中華文化促進(jìn)會(huì)文化創(chuàng)新與傳播委員會(huì)會(huì)長(zhǎng)朱建聲；西安市（EMBA助企商會(huì)）/西安市EMBA商會(huì)會(huì)長(zhǎng)張西安；鄭州天歌干細(xì)胞健康管理有限公司總經(jīng)理張永紅和上海豪景醫(yī)療器械有限公司總經(jīng)理張建國(guó)進(jìn)行了簽約儀式。主持人同中華風(fēng)采人物媒體社長(zhǎng)、新時(shí)代風(fēng)采人物研究會(huì)會(huì)長(zhǎng)、文化名人收藏大家王天保，中華風(fēng)采人物媒體主編李西紅，西藏鷹山科技集團(tuán)董事長(zhǎng)張沛分別從幾個(gè)話題闡述和討論了大健康產(chǎn)業(yè)的未來(lái)前景。為了答謝各界朋友的的支持與厚愛，活動(dòng)舉行了現(xiàn)場(chǎng)抽獎(jiǎng)環(huán)節(jié)，將活動(dòng)掀起了高潮。通過(guò)活動(dòng)一方面讓大家和身邊的朋友更關(guān)注健康。

首先，預(yù)實(shí)驗(yàn)必須要當(dāng)做正式實(shí)驗(yàn)來(lái)對(duì)待（態(tài)度要放端正，這是必須的）。預(yù)實(shí)驗(yàn)的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃，多方籌謀。不論是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇，還是檢測(cè)試劑的購(gòu)買，都盡量和正式實(shí)驗(yàn)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購(gòu)買完畢后，再去購(gòu)買實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。因?yàn)閯?dòng)物會(huì)長(zhǎng)胖，長(zhǎng)胖后給劑量就要增加，不僅多花錢，并且還容易影響實(shí)驗(yàn)效果。筆者曾經(jīng)提前將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物買回，但因?yàn)樘厥庠驔](méi)能購(gòu)買到造模，終只能忍痛割愛將動(dòng)物贈(zèng)送他人，白白虧了一筆血汗錢（那批老鼠在我這兒白吃白喝長(zhǎng)得太胖，沒(méi)辦法用作造模）。動(dòng)物及試劑購(gòu)買首先需要考慮：實(shí)驗(yàn)動(dòng)物品種、體重、性別、周齡（通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道可以獲得答案）、數(shù)量（需要考慮到實(shí)驗(yàn)有一定動(dòng)物死亡率或者動(dòng)物本身會(huì)打架互毆，因此需要提前購(gòu)買足夠的動(dòng)物）。動(dòng)物購(gòu)買的途徑、安置的地點(diǎn)，飲食管理（一般實(shí)驗(yàn)室會(huì)有動(dòng)物房，也可以從其他地方購(gòu)買），動(dòng)物免證明、倫理證明需要提前準(zhǔn)備好。實(shí)驗(yàn)相關(guān)的試劑和：比如造模和，動(dòng)物干預(yù)所需，陽(yáng)性選擇及購(gòu)買（有些購(gòu)買很困難，必須通過(guò)特殊程序才能買到）。如果涉及到有創(chuàng)操作，要提前準(zhǔn)備好（建議提前購(gòu)買），手術(shù)。需要了解自身實(shí)驗(yàn)平臺(tái)能完成哪些技術(shù)。腫瘤細(xì)胞侵襲能力檢測(cè)在學(xué)（遷移、侵襲）和免疫學(xué)（遷移、趨化）中是常規(guī)實(shí)驗(yàn)。

我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣，一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短，從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天，我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì)，蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過(guò)程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn)，一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中，二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注，然后冰上取腦，分離各腦區(qū)(嗅球，皮層，海馬，中腦，小腦，延髓，丘腦，紋狀體)后置于，用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度，即要加入適量的裂解液，加太少會(huì)使蛋白提取不充分，加太多會(huì)讓蛋白濃度太低，一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的，細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液，動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理，具體方案見討論部分。如果沒(méi)有超聲破碎儀，那就用1毫升注射器不斷抽吸，冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右，注意不要產(chǎn)生過(guò)多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取，由于文件過(guò)大，又比較血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘，這里的上樣緩沖液有兩種可選。動(dòng)物疾病模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用，但也存在一些挑戰(zhàn)。廣西大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

腫瘤細(xì)胞具有極強(qiáng)的增殖能力，在一個(gè)適宜,裸鼠成瘤是常見的驗(yàn)證腫瘤細(xì)胞體內(nèi)增殖模型。廣西大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時(shí)。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話，要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中，BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個(gè)長(zhǎng)方形，這里的寬與長(zhǎng)相對(duì)應(yīng))不大于8毫米，我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育，兩條膜"背對(duì)背"式放置于一個(gè)管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米，就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過(guò)夜，一般是12-18個(gè)小時(shí)，注意放置水平，用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況，這時(shí)可以縮短孵育時(shí)間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個(gè)小時(shí)足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗，這樣背景會(huì)干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液，我們一般一條膜一個(gè)槽地孵。2、顯影這一步有個(gè)細(xì)節(jié)可能有些同學(xué)沒(méi)注意到，就是ECL發(fā)光液要與HRP反應(yīng)一分鐘后顯影效果才會(huì)更好，還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋，一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。廣西大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)