TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先,應(yīng)采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復(fù)合物的親和力,并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外,還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能,應(yīng)確定靶抗原肽的較小識別基序(motif),并采用計算機預(yù)測分析評估交叉反應(yīng)性。如果計算機預(yù)測可識別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽,應(yīng)在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原肽的的細胞的識別能力。如果不能排除交叉反應(yīng)性,應(yīng)基于含有潛在交叉反應(yīng)性抗原肽...
基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險,量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性,或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。在開發(fā)過程中應(yīng)同時關(guān)注基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細胞中整合位點及表達。評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,評估插入突變(插入位點、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險。需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。非臨床研究是藥物開發(fā)的重要環(huán)節(jié)之一。高精度脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高...
如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。基因組整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實施時還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對靶細胞采樣,這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風(fēng)險;同時,選擇易于采樣的替代細胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過采集外周血細胞或富集外周血干細胞進行觀察。如何檢測是否發(fā)生脫靶?廣州基因療...
由于設(shè)計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更...
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對整個行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來,基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。”脫靶檢測技術(shù)是一系列針對CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用機制研發(fā)的用于確定CRISPR/Cas9系統(tǒng)基因編輯準確性檢測工具。連云港種子...
gRNA的長度和錯配: 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下,18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針:1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配;2) 在PAM的12 bp內(nèi),應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學(xué)修飾:在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?;宜狨?dǎo)致位點特異性修飾,使脫靶切割減少40-120倍,同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性,降低脫靶效應(yīng)。如何降低脫靶效應(yīng)?選擇特異的gRNA; 使用RNP; 使...
如何檢測脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測結(jié)合PCR檢測法,利用脫靶預(yù)測軟件預(yù)測潛在的脫靶位點,PCR擴增預(yù)測的脫靶位點,利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預(yù)測。全基因組測序,一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法,需要選擇適當(dāng)?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變,數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點,進一步基因擴增驗證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs,Indel...
Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個核苷酸互補的。CRISPR技術(shù)是從細菌和古細菌的自然防御機制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時,它允許對基因進行操縱,或“編輯”。脫靶切割位點已在基因編輯技術(shù),CRISPR / Ca...
不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險,建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關(guān)替代細胞的基因組中整合的影響(例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導(dǎo)致惡性liu等)。如果基因組整合相關(guān)風(fēng)險的分析可行,應(yīng)注意以下幾點:?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi),兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次,直至檢測數(shù)...
基因編輯定量脫靶檢測:基因編輯定量脫靶檢測,使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。.基于PCR的檢測唯可生物采用LTA-PCR方法分析基因組編輯引起的靶向和非靶向整合。1.方便地檢測脫靶目標(biāo)變化和隨機性2.適用于解決監(jiān)管機構(gòu)提出的具體問題3.定制化生物信息學(xué)分析基于NGS的檢測唯可生物使用靶向富集測序(TES)進行全基因組檢測和定量靶向和非靶向改變。我們可在一次反應(yīng)中經(jīng)濟高效...
不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險,建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關(guān)替代細胞的基因組中整合的影響(例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導(dǎo)致惡性liu等)。如果基因組整合相關(guān)風(fēng)險的分析可行,應(yīng)注意以下幾點:?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi),兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次,直至檢測數(shù)...
改進Cas變體使用SpCas9和SaCas9 變體:已研發(fā)出諸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多種Cas變體,可降低脫靶效應(yīng)。改進的Cas9同源物具有更廣的PAM功能和特異性:實驗表明Cpf1、CRISPR-Cpf1-RNP可降低脫靶效應(yīng)。CRISPR 遞送方法:基于病毒的遞送方法:腺病毒 (AdV) 顯示出整合到靶細胞基因組中的微弱潛力,這一特征有利于限制脫靶效應(yīng)。然而,AdVs 會引發(fā)免疫反應(yīng),目前還不能完全排除它與宿主基因組整合的可能性。非病毒遞送...
如何檢測脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測結(jié)合PCR檢測法,利用脫靶預(yù)測軟件預(yù)測潛在的脫靶位點,PCR擴增預(yù)測的脫靶位點,利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預(yù)測。全基因組測序,一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法,需要選擇適當(dāng)?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變,數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點,進一步基因擴增驗證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs,Indel...
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。基因編輯目前的脫靶分析技術(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我...
不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報,也同時伴隨著各種風(fēng)險,這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險。本文中我們盤點了多種主流的CRISPR脫靶位點檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個項目中只使用一種脫靶檢測方法也是不足夠的。如何在實驗中,特別是臨床試驗中多方面評估CRISPR的脫靶風(fēng)險,需要將多種脫靶檢測方法有效組合。同時,每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點,如何評估這種風(fēng)險,如何降低這種風(fēng)險,具體的解決方案我們用臨床實例來為大家介紹。脫靶檢測政策,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準確率高。上海育種脫靶檢...
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點,可能在整合位點處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點附近的原基因等,進而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險,例如,國外已有多項研究報告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對于存在此類風(fēng)險的產(chǎn)品,有必要進行長期隨訪臨床研究以評估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險。脫靶檢測方法,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高...
誘導(dǎo)多能干細胞來源的細胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險,在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細胞插入致突變性和致性的風(fēng)險。因此,應(yīng)在shou次臨床試驗前完成致瘤性試驗。若設(shè)計科學(xué)合理,能夠滿足評價要求,也可在持續(xù)時間足夠長的毒性研究中評估致瘤性風(fēng)險。體內(nèi)致瘤性試驗建議采用摻入未分化iPS細胞的細胞產(chǎn)品作為陽性對照,以確認實驗系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細胞設(shè)計了機制以降低致瘤風(fēng)險,應(yīng)在體內(nèi)試驗中確認/驗證此類機制的功能 高深度全基因組重測序服務(wù),該方法能多方位精細地對基因編輯的細胞或個體進行of...
CRISPR/Cas系統(tǒng)是細菌和古細菌在不斷進化的過程中產(chǎn)生的適應(yīng)性免疫防御機制,它應(yīng)用CRISPR RNA(crRNA)以堿基互補的形式引導(dǎo)相應(yīng)的Cas蛋白識別入侵的外源基因組,并對其DNA進行剪切,用以保護自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經(jīng)過人為改造后,可在真核細胞中實現(xiàn)高度靈活且特異的基因組編輯,通過設(shè)計特異性向?qū)NA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進行堿基配對,從而引導(dǎo)Cas蛋白結(jié)合到靶序列處,行使DNA切割功能,然后利用細胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homol...
目前鼓潤已掌握了該項技術(shù),簡述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實驗技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標(biāo)基因組位點的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時轉(zhuǎn)染入真核細胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點處,作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標(biāo)記。轉(zhuǎn)染后3天收集細胞的DNA進行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量測序的數(shù)據(jù)分析流程。2)利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-...
BLESS:利用生物素標(biāo)簽對DSBs進行原位標(biāo)記,后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標(biāo)記片段的富集,并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點,靈敏度與細胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS,片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭,然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測,可準確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq,將dsODN s標(biāo)簽整合到DSBs位點,通過二代測序檢測這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域,從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內(nèi)檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq,片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育,進行全基因組測序檢測脫靶...
不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報,也同時伴隨著各種風(fēng)險,這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險。本文中我們盤點了多種主流的CRISPR脫靶位點檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個項目中只使用一種脫靶檢測方法也是不足夠的。如何在實驗中,特別是臨床試驗中多方面評估CRISPR的脫靶風(fēng)險,需要將多種脫靶檢測方法有效組合。同時,每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點,如何評估這種風(fēng)險,如何降低這種風(fēng)險,具體的解決方案我們用臨床實例來為大家介紹。選擇潛在的脫靶位點,例如選擇gRNA預(yù)測網(wǎng)站上Top 5潛在脫靶位點,進行Sanger測序...
長期隨訪觀察的考慮要素:遲發(fā)性不良反應(yīng)相關(guān)的潛在風(fēng)險因素.在評估基因zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險因素時,申請人應(yīng)考慮基因zhiliao產(chǎn)品的特性,同時參考該產(chǎn)品的非臨床和臨床數(shù)據(jù)以及類似產(chǎn)品的已知數(shù)據(jù)?;騴hiliao產(chǎn)品的非臨床研究旨在為臨床研究提供支持性信息和關(guān)鍵安全性特征參數(shù),如機體中的生物分布和持久性、整合/修飾宿主基因組、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。對于新型基因zhiliao產(chǎn)品,可參考數(shù)據(jù)有限,申請人應(yīng)盡可能在非臨床研究中獲得用于評估遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險的數(shù)據(jù)。脫靶檢測服務(wù),推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準確率高。上海脫靶檢測安全性評價如果基因zhilia...
圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因編輯安全性問題,我們首先對CRISPR脫靶位點檢測技術(shù)進行一次大盤點,在sgRNA設(shè)計階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現(xiàn)象的發(fā)生。較簡單的脫靶位點檢測方法是全基因組測序(WGS),但在實際使用中,即使測序深度達到100X,也很難發(fā)現(xiàn)一些低頻率的脫靶位點,同時測序成本卻非常高。為彌補WGS的這些缺陷,常見的脫靶位點檢測技術(shù)都需要對脫靶位點進行捕獲富集,來提高檢測靈敏度,降低測序成本。按照實驗原理的不同,脫靶位點檢測技術(shù)可以分為細胞外、細胞內(nèi)和其他特殊方法這3類。針對已經(jīng)獲得的有切割能力的sgRNA,需要進一步明確其體內(nèi)脫靶效應(yīng)。江蘇基因療法脫靶檢測評估標(biāo)準BLE...
如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。基因組整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實施時還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對靶細胞采樣,這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風(fēng)險;同時,選擇易于采樣的替代細胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過采集外周血細胞或富集外周血干細胞進行觀察。脫靶檢測評估,推薦唯可生物,實驗...
CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補定位到靶位點,不論哪種CRISPR系統(tǒng),都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象,CRISPR定位到脫靶位點引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險。CRISPR技術(shù)誕生剛過10年,期間迅速取代TALEN和ZFN,成為學(xué)術(shù)界通用的基因編輯技術(shù),也徹底改變了我們的生物學(xué)研究方法。為提高CRISPR技術(shù)的安全性,特別是往臨床應(yīng)用發(fā)展時的安全性問題,研究者們一直以提高靶位點的編輯效率和準確性,同時降低脫靶位點編輯發(fā)生概率為目標(biāo),來優(yōu)化CRISPR技術(shù)。另一方面,研究者們也開發(fā)了大量檢測方法,用于檢測CRISPR的靶向風(fēng)險和脫靶風(fēng)險,用于早期sgRNA序列...
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險,需要開展長期隨訪觀察時,所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長期隨訪臨床研究。在設(shè)計長期隨訪臨床研究的方案時,應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來說,當(dāng)臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時,會影響長期隨訪觀察在評估和減輕受試者風(fēng)險方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過長期隨訪觀察...
基于已有科學(xué)經(jīng)驗和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認為基因修飾細胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細胞進行基因整合位點分析,分析細胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點的細胞有無優(yōu)先異常增殖。對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評估其靶點相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險。基因編輯脫靶將無處隱藏。常州育種脫...
長期隨訪的觀察時間長期隨訪的持續(xù)時間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況(生物分布和給藥途徑)等導(dǎo)致的風(fēng)險,應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時間。一般而言,針對不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下:?具有基因組整合活性的載體(例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體)和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風(fēng)險的細菌或病毒載體(如單純皰疹病毒)建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(ganran或再jihuo)?;蚓庉嫯a(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險?;蚓庉嫾夹g(shù)脫靶檢測,推...
如何檢測脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測結(jié)合PCR檢測法,利用脫靶預(yù)測軟件預(yù)測潛在的脫靶位點,PCR擴增預(yù)測的脫靶位點,利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預(yù)測。全基因組測序,一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法,需要選擇適當(dāng)?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變,數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點,進一步基因擴增驗證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs,Indel...
CRISPR/Cas系統(tǒng)是細菌和古細菌在不斷進化的過程中產(chǎn)生的適應(yīng)性免疫防御機制,它應(yīng)用CRISPR RNA(crRNA)以堿基互補的形式引導(dǎo)相應(yīng)的Cas蛋白識別入侵的外源基因組,并對其DNA進行剪切,用以保護自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經(jīng)過人為改造后,可在真核細胞中實現(xiàn)高度靈活且特異的基因組編輯,通過設(shè)計特異性向?qū)NA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進行堿基配對,從而引導(dǎo)Cas蛋白結(jié)合到靶序列處,行使DNA切割功能,然后利用細胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homol...